Новости Новосибирского Научного Центра

Новосибирский Научный Центр.
Новости. События. История. Интервью. Прогнозы. Анонсы

Рис – вместо таблеток «от давления»

<i>(Рис – вместо таблеток «от давления»)</i> (2020.07.03) (Пресс-служба ФИЦ ИЦиГ СО РАН)

Два последних десятилетия отмечены быстрым прогрессом биоинформатики и соответственно ростом интереса к этой молодой научной дисциплине со стороны научного сообщества и высокотехнологичного бизнеса. По мере развития экспериментального оборудования и информационных технологий, расширяется спектр фундаментальных и прикладных научных задач, которые удается решать с помощью биоинформатики. Исследования в этой области составляют существенную часть научной работы, проводимой в рамках Курчатовского геномного центра мирового уровня, в число организаторов которого входит ФИЦ ИЦиГ СО РАН. Один из ключевых проектов – создание библиотеки моделей геномов на основе коллекций микроорганизмов, которыми располагают научные институты нашей страны. Как отмечают участники проекта, речь не идет только о секвенировании генома, что в последние годы стало уже рутинной научной процедурой. – Секвенирование дает нам последовательность генов в ДНК организма, но это лишь первый шаг, - рассказал ведущий научный сотрудник отделения «Курчатовский геномный центр ИЦиГ СО РАН», к.б.н. Сергей Лашин. – Следующий этап заключается в построении на основе геномной информации метаболической карты организма (какие биохимические реакции могут протекать в данном организме), а также карты генетической регуляции, с помощью которой мы показываем, как взаимодействуют между собой гены. А затем, на основе этих карт, мы уже строим математические модели, где описываем, как происходит синтез определенного целевого продукта этим микроорганизмом. В итоге, ученые получают не только достоверные данные о потенциале конкретной бактерии для производства тех или иных необходимых промышленности продуктов, но и понимание, как с помощью современных генетических технологий можно менять параметры этого процесса (например, повысить интенсивность синтеза вещества или изменить какие-то его характеристики). Одновременно с фундаментальными научными задачами, решаются и вполне прикладные: идет отбор микроорганизмов, потенциально пригодных для синтеза некоторых органических кислот, востребованных в производстве кормов для нужд сельского хозяйства. Проанализировав геномы двухсот с лишним микроорганизмов из коллекций, новосибирские биоинформатики отобрали 17 перспективных бактерий, которые теперь будут изучены более детально. При этом, подчеркивают они, работа с остальными геномами была не напрасной, поскольку выявленные у них характеристики описаны и могут быть использованы для решения других задач. А список возможного применения микроорганизмов в биотехнологической промышленности постоянно расширяется: одни бактерии используют в синтезе сырья для фармакологической промышленности, другие – нефтедеструкторы – для ликвидации загрязнения окружающей среды нефтепродуктами (такими, как недавний разлив дизельного топлива в Норильске), третья – в процессах переработки мусора, позволяющих превращать отходы в полезный продукт (биотопливо и т.п.). Поэтому глобальная цель проекта, реализуемого подразделениями Курчатовского геномного центра – создать библиотеку моделей всех микроорганизмов, входящих в коллекции институтов, а их порядка десяти тысяч. Такая библиотека станет мощным ресурсом для развития отечественной биотехнологической промышленности. Одна из главных задач на этом пути – оптимизация самого процесса. Сам опыт подобного анализа и моделирования генома есть и у наших, и у зарубежных ученых, но обычно работа с одним геномом бактерии требует у исследователей от полугода до года работы. Теперь же требуется обработать тысячи геномов за пять лет. Очевидно, что это возможно лишь при максимальной автоматизации всех процессов. – На сегодня хорошо автоматизирован лишь процесс самого секвенирования, есть решения в области построения «рамочных» полногеномных моделей, а вот уточнённые математические модели обычно по-прежнему требуют «доводки в ручном режиме», на что уходит много времени – отметил Сергей Лашин. – И сейчас мы, параллельно с анализом геномов из коллекций, работаем и над автоматизацией этой части работы. Новосибирские ученые рассчитывают, что уже к концу года смогут создать готовую программную платформу, которая максимально сократит срок работы с отдельным геномом микроорганизма. Первые результаты работы над ней планируется обсудить на заседаниях специального симпозиума в рамках XII международной мультиконференции «Биоинформатика и системная биология» (BGRS/SB-2020), которая пройдет с 6 по 10 июля 2020 года в Новосибирске. Организаторы симпозиума рассчитывают не только на обмен опытом с российскими и зарубежными коллегами, но и на возможное сотрудничество в развитии этой платформы. Поскольку на сегодня ее аналогов в открытом доступе просто нет, а вот запрос на появление такого программного продукта очень высок. Пресс-служба ФИЦ ИЦиГ СО РАН
   (2020.07.03) (Пресс-служба ФИЦ ИЦиГ СО РАН)

Установка антенн в Новосибирске
Установка антенн в Новосибирске

услуги по монтажу оборудования для усиления сигнала GSM-связи. Квалифицированная консультативная и техническая поддержка.

СТО «ФулТехСервис»
СТО «ФулТехСервис»

Кузовной ремонт, покраска легковых и грузовых а/м. Ремонт пластмасс, бамперов антикорозийная обработка днища Диагностика и ремонт ходовой части Капремонт и то двигателя, ремонт глушителей Диагностика сканером Шиномонтаж Поиск и доставка запчастей

Компания «Мусору-Нет»
Компания «Мусору-Нет»

Динамично развивающаяся компания, основанная в 2005 году. Компания оказывает услуги по сбору, транспортировке и сдачи на полигон отходов в Новосибирске и Новосибирской области. Вывоз мусора бункерами очень удобен и часто используется в жилом фонде, частном секторе, организациях и на строительных площадках.

Стоматологическая клиника «АРТА»
Стоматологическая клиника «АРТА»

В клинике «АРТА» работают врачи-стоматологи всех направлений. Это значит, что вы экономите свои силы и время, обращаясь к нам, ведь вам не придется посещать несколько врачей в различных клиниках. Здесь вы можете получить консультацию, пройти полное обследование ротовой полости с использованием самого современного и точного оборудования, получить помощь в решении любых стоматологических проблем.

ООО «Грузим с умом»
ООО «Грузим с умом»

Услуги грузчиков в Новосибирске. В грузоперевозках уже более 12 лет. Более 30 грузовых машин, оперативное предоставление транспорта с грузчиками на заказы по Новосибирску, Бердску и Кольцово

Новосибирский Научный Центр. Новости. События. История. Интервью. Прогнозы. Анонсы
Яндекс.Метрика
8122af2d77b5b5744fcbcff0ecf080a8 c5dec174dbadfa5c7e3aeb247c708a46